รองศาสตราจารย์ ดร.ประชุมพร คงเสรี

Assoc.Prof. Prachumporn Kongsaeree

  • Education Background

    Ph.D. Biochemistry University of Sydney, Australia
    B.Sc. (Honours Class I) Biochemistry University of Sydney, Australia

  • Area of Expertise

    Protein engineering
    Enzymology
    Molecular biology

  • Research Interests:

    Structure-function relationships in cellulose-degradating enzymes
    Metagenomic approaches to discover novel cellulose-degradating enzymes
    Enzymatic synthesis of useful glucosides



Substrate specificity engineering of beta-glucosidases
Beta-glucosidases from different sources exhibit distinct specificities for their substrates, reflecting their diverse biological functions.Some beta-glucosidases can catalyze synthetic reactions with variable efficiencies.
Unique catalytic properties of these beta-glucosidasesare determined by the amino acid residues in the active pocket. We have been able to identify the residues that direct substrate specificities for both glycone and aglycone groups. As such, we can generate mutant beta-glucosidases with desired properties.


Applications of beta-glucosidases in hydrolysis of cellulosic biomass
Cellulose is a long chain polymer of beta-1,4-glucose.Hydrolysis of cellulose is inhibited by high concentration of glucose. Highly glucose-tolerant beta-glucosidases (HGT-BG) from different sources, such as fungi, termite and bovine rumen, have been characterized for their applications in hydrolysis of cellulosic biomass. Our results shed light on the nature of HGT-BG enzymes from  natural sources. Our fungal beta-glucosidase  shows a high potential to be used in cellulose saccharification, and was in fact superior to the commercial cellobiase.

Synthesis of alkyl glucosides by engineered beta-glucosidases
Long-chain alkyl glucosides are used as nonionic, biodegradable surfactants, in cosmetics, pharmaceuticals and cleaning products. Our mutant beta-glucosidases are good candidates for alkyl glucoside synthesis via reverse hydrolysis between glucose and alkyl alcohols.  Indeed, our mutant beta-glucosidasesgave higher yields of long-chain alkyl glucosides than the commercial or natural beta-glucosidases.

Examples
of publications

Scroll down

1.Ratananikom, K., Choengpanya, K., Tongtubtim, N., Charoenrat, T., Withers, S.G. and Kongsaeree, P.T. (2013) Mutational analysis in the glycone binding pocket of Dalbergia cochinchinensis -glucosidase to increase catalytic efficiency towards mannosides. Carbohydr. Res. 373, 35-41.

2.Thongpoo, P., McKee, L.S., Araújo, A.C., Kongsaeree, P.T. and Brumer, H. (2013) Identification of the acid/base catalyst of a glycoside hydrolase family 3 (GH3) -glucosidase from Aspergillus niger ASKU28. BBA – Gen Subjects 1830, 2739-2749.

3.Stepper, J., Dabin, J., Eklof, J.M., Thongpoo, P., Kongsaeree, P., Taylor, E.J., Turkenburg, J.P., Brumer, H. and Davies, G.J. (2013) Structure and activity of the Streptococcus pyogenes family GH1 6-phospho--glucosidase SPy1599. Acta Cryst. D69, 16-23.

4.Sukkhum, S., Tokuyama, S., Kongsaeree, P., Tamura, T., Ishida, Y. and Kitpreechavanich, V. (2011) A novel poly (L-lactide) degrading thermophilic actinomycetes, Actinomadura keratinilytica strain T16-1 and pla sequencing. Afr. J. Microbiol. Res. 5, 2575-2582.

5.Kwan, D.H., Chen, H.-M., Ratananikom, K., Hancock, S.M., Watanabe, Y., Kongsaeree, P.T., Samuels, A.L. and Withers, S.G. (2011) Self-immobilizing fluorogenic imaging agents of enzyme activity. Angew. Chem. Int. Ed. 50, 300-303.  

6.Kongsaeree, P.T., Ratananikom, K., Choengpanya, K., Tongtubtim, N., Sujiwattanara,t P., Porncharoennop, C., Onpium, A. and Svasti, J. (2010) Substrate specificity in hydrolysis and transglucosylation by family 1 -glucosidases from cassava and Thai rosewood. J. Mol. Catal. B. – Enzym. 67, 257–265.

7.Chuankhayan, P., Rimlumduan, T., Tantanuch, W., Mothong, N., Kongsaeree, P.T., Metheenukul, P., Svasti, J., Jensen, O.N. and Ketudat Cairns, J.R. (2007) Functional and structural differences between isoflavonoid -glycosidases from Dalbergia sp. Arch. Biochem. Biophys. 468, 205–216.

8.Toonkool, P. and Tongtubtim, N. (2006) Nucleotide and derived amino acid sequences of the cyanogenic b-glucosidase (linamarase) from cassava (Manihot esculenta Crantz). Kasetsart Journal (Natural Science). 40, 123-128.

9.Wechkrajang, S., Vichukit, V., Toonkool, P. and Nakasathien, S. (2006) Anatomical characterization and protein profiles in adventitious and storage roots of two commercial Thai cassava varieties. Kasetsart Journal (Natural Science). 40, 297-305.   

10.Toonkool, P., Metheenukul, P., Sujiwattanarat, S., Paiboon, P., Tongtubtim, N., Ketudat-Cairns, M., Ketudat-Cairns, J. and Svasti, J. (2006) Expression and purification of dalcochinase, a -glucosidase from Dalbergia cochinchinensis Pierre, in yeast and bacterial hosts. Protein Expres. Purif. 48, 195–204.

11.Mackay, J.P., Muiznieks, L.D., Toonkool, P. and Weiss, A.S. (2005) The hydrophobic domain 26 of human tropoelastin is unstructured in solution. J. Struct. Biol. 150, 154-162.

12.Toonkool, P., Ketudat-Cairns, J. and Svasti, J. (2003) Beta-glucosidases from Thai plants. วารสารวิทยาศาสตร์ มศว. 19, 1-10.

13.Svasti, J., Ketudat-Cairns, J., Srisomsap, C., Surarit, R., Techasakul, S. and Toonkool, P. (2003) Structure and properties of -glucosidases from Thai plants. In Protein Structure-Function Relationship. (A. Abbasi and S.A. Ali, eds.), BCC&T, University of Karachi, Karachi, pp 221-240.

14.Toonkool, P., Regan, D.G., Morris, M.B., Kuchel, P.W. and Weiss, A.S. (2001) Thermodynamic and hydrodynamic properties of human tropoelastin: analytical ultracentrifuge and pulsed field-gradient spin-echo NMR studies. J. Biol. Chem. 276, 28042–28050.

15.Toonkool, P., Jensen, S.A., Maxwell, A.L. and Weiss, A.S. (2001) Hydrophobic domains of human tropoelastin interact in a context-dependent manner. J. Biol. Chem. 276, 44575–44580.

16.Toonkool, P. and Weiss, A.S. (2001) Expression of recombinant human tropoelastin in Saccharomyces cerevisiae containing a synthetic gene with a high codon adaptation index coupled to the SUC2 invertase signal sequence. Acta Biotechnol. 21, 189–193.

ปีรายละเอียด
2011ทุนอุดหนุนวิจัย มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ 4 โครงการ (1) พ.ศ. 2547–2549 (2) พ.ศ. 2550-2552 (3) พ.ศ. 2553-2554 และ (4) พ.ศ. 2555-2557
2011ทุนเพิ่มขีดความสามารถด้านการวิจัยของอาจารย์รุ่นกลางในสถาบันอุดมศึกษา จากสำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย ร่วมกับสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา พ.ศ. 2554-2557
2011ทุนโครงการปริญญาเอกกาญจนาภิเษก จากสำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย พ.ศ. 2554-2559
2009ทุนวิจัยมหาบัณฑิต สกว.-สถาบันการศึกษา (MAG Window II) พ.ศ. 2552–2554
2008ทุนวิจัย จากสำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ พ.ศ. 2551
2008ทุนการศึกษาระดับปริญญาเอกภายในประเทศ จากสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา พ.ศ. 2551-2555
2007ทุนการศึกษาระดับปริญญาเอกร่วมใน-ต่างประเทศ จากสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา พ.ศ. 2549-2553 และ พ.ศ. 2550-2554
2006ศูนย์ประสานงานนักเรียนทุนรัฐบาลทางด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ พ.ศ. 2549-2550
2006ทุนพัฒนาศักยภาพในการทำงานวิจัยของอาจารย์รุ่นใหม่ จากสำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย ร่วมกับสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา พ.ศ. 2546-2548 และ พ.ศ. 2549-2551
2005ทุนวิจัยมหาบัณฑิต สกว. พ.ศ. 2548-2549
2004Wood-Whelan Research Fellowship พ.ศ. 2547
2003Research Grant Programme from Third World Academy of Science พ.ศ. 2546–2548
ปีรายละเอียด
2004Wood-Whelan Research Fellowship (to conduct research at Karolinska Institute, Stockholm, Sweden)
2002FAOBMB Travel Fellowship (to attend the 16th Federation of Asian and Oceanian Biochemists Symposium in Taipei, Taiwan.
2000IUBMB Young Scientist Travel Fellowship (to attend the 18th International Congress of Biochemistry and Molecular Biology in Birmingham, U.K.)
1996Sydney University Biochemistry Alumni Award (for outstanding performance in third year Biochemistry examinations)
1996Grainger Scholarship, Wesley College, University of Sydney (for proficiency in third year barrier examinations)
1995Grainger Scholarship, Wesley College, University of Sydney (for proficiency in second year barrier examinations)
1994Chapman Scholarship, Wesley College, University of Sydney (for proficiency in first year barrier examinations)
1992Royal Thai Government Scholarship (for undergraduate and postgraduate studies in Australia)
  • Khuanjarat Choengpanya (Ph.D. student (Genetic Engineering))
  • Eukote Suwan (Ph.D. student (Genetic Engineering))
  • Pornpanna Thenchartanan (Ph.D. student (Biochemistry))
  • Satrawut Charoenla (M.S. student (Biochemistry))
  • Siripun Artornturasook (Research assistant)